原住民代金制度旨在促進原住民族就業，為現行原住民族之保障扶助發展措施之一，然隨著實務操作的推展，代金制度引發爭議與質疑，監察委員紀惠容表示，近日有民間團體陳訴指出，承接政府採購案時，因未依規定比率僱用原住民，遭原住民族委員會課處原住民族就業代金，金額竟高達採購金額逾二成，嚴重衝擊業者經營。

行政院會2月15日通過「原住民族工作權保障法」部分條文修正草案，未來得標廠商應繳納代金金額若超過政府採購決標金額一定比率，將另定減輕機制，後續將送立法院審議，並設定3年緩衝期後施行。